根据国家新冠疫苗接种工作的统一部署，北京市从2021年10月20日起，在全市范围内启动新冠病毒疫苗加强针接种。

2021年初，校医院应上级要求，为全校师生进行了新冠疫苗第一针和第二针的集体接种。在接种第一针时除了各项周密的部署外，还特别设计了“疫苗接种提示卡”，标记出第二针接种的时间、接种后注意事项、常见不良反应及处置措施，共印制2万余份，做到人手一份，对接种者起到了有效的提示和指导作用。

2021年10月，校医院接到上级指示后，立即行动起来。虽然正处于教职工体检期间，医院克服时间紧、任务重、人员紧张疲劳等种种困难，积极做好接种前的各项准备及宣传工作。首先，保健科撰写了新冠疫苗加强针接种指南等宣传稿件，通过校医院微信公众号推送，告知大家在新冠灭活疫苗全程接种2针或新冠病毒腺病毒载体疫苗（康希诺疫苗）接种1针，满6个月的18岁以上人群可以接种加强针。重组新冠病毒疫苗全程免费3针，此次不需要加强免疫。同时告知优先保障重点人群的疫苗接种、加强针种类的接种原则、禁忌症及注意事项等，并提醒符合加强免疫条件的师生携带身份证、护照等相关证件，做好个人防护，到东校区礼堂有序开展加强针接种，提高免疫水平，增强自我保护能力。第二，与学校各部门积极沟通联系，协调各部门职责，共同做好接种场地、物资、设备的购买、安装、调试。紧急购买了电脑、冰箱等，用于接种及疫苗贮存。第三，做好校医院人员排班、培训及后勤保障工作，合理安排，保证体检、疫苗接种两不误。

2021年11月11日下午，新冠疫苗加强针接种于东校区礼堂正式启动。在志愿者和医护人员的引导下，师生们从入门测量体温，知情同意书签写，到登记台信息核对、接种、留观、离场，整个接种过程井然有序，通过使用新冠疫苗接种登记台核对表，保证每日上千人接种数量完全准确。本次接种，校医院还在三个接种通道中，每天评选一组接种冠军，进行表彰。目前已经完成6265人次。